Молекулярная изменчивость и генетическая структура вируса омской геморрагической лихорадки на основе анализа полногеномных последовательностей

Abstract

Вирус омской геморрагической лихорадки (OHFV) –возбудитель опасной природно-очаговой инфекции. В GenBank зарегистрировано четыре полных генома вируса, что недостаточно для установления генетического разнообразия OHFV и понимания его эволюционной истории. В настоящей работе впервые определены 15 новых геномов OHFV. Полученные данные позволили проанализировать молекулярную изменчивость и установить генетическую структуру OHFV. Результаты показали, что генетическое разнообразие OHFV значительно шире, чем считалось ранее, а популяция вируса представлена как минимум тремя субтипами, a не двумя как считалось ранее.

Omsk hemorrhagic fever virus (OHFV) is the causative agent of a dangerous natural focal infection. Four complete genomes of the virus are registered in GenBank, which is not enough to establish the genetic diversity of OHFV and understand its evolutionary history. In this work, 15 new OHFV genomes have been identified for the first time. The data obtained made it possible to analyze the molecular variability and establish the genetic structure of OHFV. The results showed that the genetic diversity of OHFV is much broader than previously thought, and the virus population is represented by at least three subtypes, not two as previously thought.