Пожалуйста, используйте этот идентификатор, чтобы цитировать или ссылаться на этот ресурс: http://hdl.handle.net/10995/21119
Название: Генетическая структура популяций боррелий на территории России
Другие названия: Genetic structure of Borrelia sp. populations in Russia
Авторы: Мухачева, Т. А.
Mukhacheva, T. A.
Научный руководитель: Ковалев, С.Ю.
Дата публикации: 2013
Издатель: б. и.
Библиографическое описание: Генетическая структура популяций боррелий на территории России: заключительный отчет о НИР / Урал. федер. ун-т им. первого Президента России Б. Н. Ельцина ; Руководитель С. Ю. Ковалев ; Исполнитель Т. А. Мухачева. – Екатеринбург, 2013. – 16 с.
Аннотация: Иксодовый клещевой боррелиоз – природно-очаговое заболевание, возбудителем которого являются спирохеты рода Borrelia. На территории таежной зоны России регистрируется по меньшей мере 3 геновида боррелий, патогенных для человека, – B.afzelii, B.garinii и B.miyamotoi. Кроме того, в последнее время внутри B.garinii был выделен новый вид B.bavariensis. Целью данного исследования стало проведение молекулярно-генетической характеристики боррелий на территории России. В ходе исследования были типированы 50 штаммов и изолятов ДНК боррелий (собранных в разных регионах страны от Санкт-Петербурга до Владивостока) с помощью общепринятого метода мультилокусного сиквенс-типирования (MLST). При этом было получено 27 новых сиквенс-типов. Филогенетический анализ позволил предположить азиатское происхождение B.afzelii и B.bavariensis, а также выявил сложную филогенетическую структуру B.garinii. Наши данные подтверждают гипотезу, согласно которой ключевым фактором в распространении боррелий является видовой состав прокормителей клещей, к которым адаптирован конкретный вид. В связи с невозможностью проводить типирование смешанных образцов нами была дополнена ранее разработанная система дифференциации видов боррелий (B.afzelii, B.bavariensis, B.garinii, B.miyamotoi) методом ПЦР в реальном времени. Её применение позволило значительно повысить эффективность исследования и дало возможность выбора интересующих видов боррелий для анализа.
Lyme disease is a natural focal infection caused by spirochetes of the genus Borrelia. In Russia, at least three pathogenic Borrelia genospecies are common: B.afzelii, B.garinii, and B.miyamotoi. Additionally, a new species, B.bavariensis, was recently characterized. The aim of the present study was to carry out a molecular genetic analysis of Borrelia sp. in Russia. Fifty strains and DNA isolates of Borrelia from different regions of Russia (from St Petersburg to Vladivostok) were typed according to the multilocus sequence-typing (MLST) scheme. Twenty-seven of them were new and not presented in the international database. Phylogenetic analysis allowed to suggest the Asian origin of B.afzelii and B.bavariensis, as well as revealed a complex phylogenetic structure of B.garinii. Our data support the hypothesis that a key factor in the spread of Borrelia species may be adaptation to different vertebrate hosts such as rodents and birds. As it was impossible to type mixed Borrelia samples, we have improved our system of differentiation of Borrelia species (B.afzelii, B.bavariensis, B.garinii, and B.miyamotoi) by real-time PCR. It allowed us to carry out the analysis more efficiently and to select species of interest for the further examination.
Ключевые слова: ОТЧЕТ О НИР
БОРРЕЛИИ
КЛЕЩ
ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ
МУЛЬТИЛОКУСНОЕ ТИПИРОВАНИЕ
ПОПУЛЯЦИЯ
BORRELIA
TICKS
GENETIC DIVERSITY
MULTILOCUS SEQUENCE TYPING
POPULATION
URI: http://hdl.handle.net/10995/21119
Сведения о поддержке: Программа развития УрФУ на 2013 год (п.1.2.2.3)
Располагается в коллекциях:Гранты, проекты, отчеты

Файлы этого ресурса:
Файл Описание РазмерФормат 
mukhacheva_1.2.2.3_21.pdf423,36 kBAdobe PDFПросмотреть/Открыть


Все ресурсы в архиве электронных ресурсов защищены авторским правом, все права сохранены.